A Escola Estadual "Maroja Neto" foi fundada, em 1972, no governo de Fernando Guilhon. Marcou o início da implantação da Reforma Educacional no Estado (Lei 5692/71), homenageando a memória de um cidadão culto, simples e ilustre que muito contribuiu para a grandeza e progresso do Pará: o desembargador Manoel Maroja Neto, nascido em 17/07/1880, na antiga Vila do Pilar, no estado da Paraíba, e falecido no Rio de Janeiro, em 21/02/1964.
Instalada em 25 de fevereiro de 1972, a Escola iniciou suas atividades em 24/04/1973 e recebeu autorização de funcionamento de 1ª a 6ª séries, em caráter provisório, por meio da resolução de nº 29 de 20/04/1972. O ensino do então 1º Grau, de 5ª a 8ª série, funcionou de 1972 a 1975, sob a administração do professor Edílson Santos. A partir de 1976 passou a funcionar somente com o ensino de 1ª a 4ª série. Em 1998, passou a atender novamente os alunos de 5ª a 8ª séries.
O ensino supletivo foi implantado a partir de 1978, com o ensino de 1ª e 2ª etapas e, no ano de 1985, com a 3ª e 4ª etapas. O Ensino Médio na modalidade supletivo começou a funcionar no ano de 2002. Atualmente, a direção da escola é de responsabilidade do professor Adilson Cordeiro.